叔丁醇和其他丁醇相比有较高的毒性和麻醉性，和其它醇相比有较高的毒性和麻醉性，吸入对身体有害。对眼睛、皮肤、黏膜和呼吸道有刺激作用。储存于阴凉、通风的库房，库温不宜超过30℃。保持容器密封。应与氧化剂、酸类等分开存放，切忌混贮。小编在这里介绍它的毒性，希望大家在使用的时候可以避免发生想不打的意外。
　　叔丁醇对环境的影响，主要是吸入、口服或以皮肤吸收后对身体有害。对眼睛、皮肤、粘膜及上呼吸道有刺激作用。吸入后可引起喉、支气管的炎症、水肿、痉挛及化学性肺炎、肺水肿。接触后可引起灼烧感、咳嗽、喘息、气短、头痛、恶心及呕吐等。可引起过敏反应。一般没事，弄到身上用清水洗掉就可以了。叔丁醇储存于阴凉、通风的库房。
　　由于叔丁醇作为冻干剂具有多重优势，已被广泛用于制剂中，纯的叔丁醇可以单独作为溶剂，溶解水不溶性药物或水中稳定性不好的药物，进行冻干。目前国内外研究较多是叔丁醇与水形成共溶剂体系进行冷冻干燥，其在药剂领域中应用有多个方面叔丁醇储存于阴凉、通风的库房。